在北伐和西晋的同时，朱元璋于洪武元年命廖永忠和朱亮祖在平定福建以后，由海陆进攻，广东三月，何真奉表请降四月，廖永忠到东莞受下广东，就此平定。
随后，朱亮祖带领军队经梧州玉林进入广西，与杨京所部会合，一举平定了广西。
洪武四年正月，朱元璋任命唐和为征西将军周德清和廖永忠为副将军率水军溯长江而上，任命付有德为征路钱将军顾实为副将军领布齐从陕西南下两路明军水陆并济攻打宁夏，唐河大军兵临重庆名声出城投降，宁夏政权就此灭亡。
七月付有德攻破成都四川就此平定。至此，国内参与的割据势力就只剩下盘踞在云南的蒙古梁王法萨拉瓦尔密和在辽东金山迎兵二十万的那哈出了洪武十四年，朱元璋亲自制定了收复云南的作战计划，命付有德蓝玉和木英同兵出击梁王巴扎拉瓦尔密在曲靖部下十万精兵抵挡明军傅有德和郭英带领明军。
在白石江边与曲靖守军大力麻展开决战，最终明军大胜生擒大力麻援军横尸十余里。
梁王得知，曲靖兵败的消息以后，急忙弃守了昆明城明军出师，仅仅百日就拿下了昆明后五十五年，蓝玉幕营进兵大理断时，聚众私守下关蓝玉分兵两路，一举将大力军击溃。
云南就此彻底平定之后，朱元璋在云南设置三思，并留下牧婴世代镇守拿下。
云南以后，朱元璋将目标瞄准了辽东地区洪五二十年。正月，朱元璋任命冯胜为正鲁大将军傅有德贺兰玉为副将军率领大军二十万讨伐那哈楚明军包围金山以后，纳哈楚最终率众投降班师挥京的途中，冯胜有一路扫荡残敌，俘获伤残藩军两万余人和大批斩车军马等物资。
然后冯胜将降将家属安顿在信州。至此，辽东彻底平定平定。
辽东以后，朱元璋把彻底苏清蒙古大漠提上日程。洪武二十年九月，朱元璋任命刚刚平定，辽东得胜回朝的蓝玉为征鲁大将军。
洪武二十一年四月，兰玉率领十五万明军。在捕鱼洱海大败，北元军队彻底摧毁了北元朝廷，使得大兴安岭以东的蒙古逐部处于群龙无首的境地，最终不得不归复了。
明朝洪武二十二年，朱元璋在齐地设置了躲延扶余和太宁三位，合称躲延三魏。
由于某古人称呼朵延位为雾良哈，所以也被叫做木良哈。
三位随着在关内统治的巩固，朱元璋开始逐渐将势力向河西推进，先后在哈密以东的酒泉和青海柴达木盆地的周围建立了赤金安定曲仙阿端汉东汉东佐以及沙洲等七个位所史称关西七魏洪武二十四年八月，朱元璋命左军都督千使刘贞和宋胜领兵从扬州出发征讨哈密。
一年以后，哈密城主乌纳失礼派，使臣向明军投降，哈密正式归属明朝。
朱元璋随后设立哈密卫，标志着明朝对西域地区开始行使主权。
在大明建国以后的二十多年时间里，朱元璋审时度势运筹帷幄，功夫兼师各个击破以其卓越的佣兵才能和驾驭战争的能力。
先后任用不同的将领西平晋广突定中原突袭大都推翻原廷西克晋陕收复肝脏突克，四川拿下云南破降，辽东扫清大漠，深入西域，最终完成了统一大业。
